Das Verfahren der Transkriptionsprofilierung ist in der linken Abbildung dargestellt. Der Vulkan-Plot visualisiert die differentiell exprimierten Gene, wobei rot markierte Gene eine Hochregulation und blau markierte Gene eine Herunterregulation aufzeigen. Zusätzlich wird eine Heatmap der 20 am stärksten hochregulierten Gene im Vagusnerv von SARS-CoV-2-Patienten im Vergleich zu Kontrollproben präsentiert.
HSA KIT: Präzise Analyse von Beta-Amyloid-, Tau-, HLA- und GFAP-Signalen mit Deep Learning
Beta-Amyloid
Das Beta-Amyloid Protein kann in den folgenden Morphologien auftreten:
Core
Punctate
Vascular
Diffuse
Die präzisere Messung dieser Plaque-Morphologien und -Kategorien ermöglicht eine genauere Erkennung des Fortschreitens der Krankheit sowie ein besseres Verständnis der zugrunde liegenden Pathophysiologie. Dies kann wertvolle Hinweise auf die Mechanismen der Erkrankung liefern und neue Ansätze für Diagnose und Therapie eröffnen.
Tau
Tau ist ein Protein, das eine wesentliche Rolle bei der Stabilisierung von Neuronenstrukturen spielt. Bei abnormaler Anhäufung kann es jedoch neurodegenerative Erkrankungen wie Alzheimer fördern. Die Detektion von Tau-Protein bei Covid-19-Patienten legt nahe, dass das Virus potenziell langfristige neurokognitive Auswirkungen haben könnte.
Das Tau-Protein kann in den folgenden Morphologien auftreten:
- Tau tangle
- Pre tangle
- Tau neurotic
- Tau thread
Humane Leukozyten-Antigen-Signale (HLA-Signal)
HLA-Signale sind genetische Marker, die auf der Oberfläche von Körperzellen exprimiert werden. Diese Marker sind entscheidend für die Fähigkeit des Immunsystems, zwischen körpereigenen Zellen und fremden Substanzen wie Viren, Bakterien oder transplantiertem Gewebe zu unterscheiden.
HLA-Signale können folgende Morphologien aufweisen:
- Microglia process
- Microglia activated
- Microglia resting
- Microglia nodule
- Microglia phagocytic
Saures Gliafaserprotein (GFAP)
GFAP ist ein grundlegendes Protein, das hauptsächlich in Astrozyten, spezialisierten Zellen des zentralen Nervensystems, vorkommt. GFAP ist ein wichtiger Biomarker in der Hirnforschung und wird primär mit neurologischen Prozessen in Verbindung gebracht. Im Bereich des Deep Learning wird GFAP jedoch kaum eingesetzt. Stattdessen greifen Deep-Learning-Modelle auf verschiedene datenbasierte Ansätze und neuronale Netzwerke zurück, um komplexe Fragestellungen zu lösen.
Region
Das HSA KIT ermöglicht eine genaue Erkennung der betroffenen Regionen und eine differenzierte Analyse von weißer Substanz und Kortex innerhalb einer einzelnen Probe.
Rauszoomt: Automatische Erkennung der Gehirnareale, gefolgt von der automatischen Unterteilung des Cortex in 6 Layer.
Automatische Unterteilung des Cortex in 6 Layer mit HSA KIT
Die HSA KIT Software ermöglicht die präzise und automatische Unterteilung des Cortex in sechs Layer, um eine detaillierte Analyse der verschiedenen Zell- und Struktureigenschaften im Gehirn durchzuführen. Diese Methode erfasst und vergleicht spezifische Merkmale wie die Verteilung und Dichte von Strukturen (z. B. Tau oder HLA) in den einzelnen Layern
Detaillierte Information zur Tabelle:
Case: Die untersuchte Probe oder Szene.
ROI (Region of Interest): Die spezifische Region oder Schicht,
Object Count und Total Area (µm²) geben Auskunft über die Dichte der Objekte in einer Schicht und wie viel Fläche sie einnehmen.
% of area of this layer und % area of Base ROI ermöglichen den Vergleich der Dichte und Verteilung der Strukturen zwischen verschiedenen Layern und der gesamten Region.
% area of this category over the same objects in Base ROI und % area of this category over the main class in this layer sind besonders wichtig, um die Verteilung der Strukturen im Verhältnis zu ihrer Hauptkategorie und im gesamten ROI zu verstehen.
Diese Daten helfen dabei, die Verteilung und Dichte von Strukturen im Cortex zu analysieren, und sind entscheidend, um Unterschiede zwischen verschiedenen Layern zu erkennen – ein wesentlicher Schritt für die Untersuchung von Krankheitsmustern.
HSA KIT
Die HSA KIT Software mit dem Modul „Neuro COVID-19“ fokussiert sich auf Next-Generation-Sequencing-Daten und ermöglicht ein tieferes Verständnis von Erkrankungen.
Das „Neuro COVID-19“-Modul nutzt KI, um durch das Training mit einem Datensatz bekannte Informationen zu erkennen. Die KI kann unlabeleten Sequenzen automatisch identifizieren und mithilfe von Deep Learning-Algorithmen weitere, vergleichbare Daten finden. Dadurch erhält man einen umfassenden Überblick über die klinische Relevanz und Schwere von Datenvarianten. Diese prädiktiven Analysen bieten Ärzten, Forschern und Laboren wertvolle diagnostische Unterstützung.
Digitalisierung histologischer Gewebeschnitte und Analyse mit dem HSA KIT
Das HSA KIT unterstützt den Import und die Bearbeitung von „NDPI“-Dateien, die vom Hamamatsu NanoZoomer 2.0 HT – einem fortschrittlichen Objektträger-Scanner – erstellt werden. Diese Dateien sind perfekt auf das HSA KIT abgestimmt und ermöglichen eine reibungslose Analyse.
Kein Slide-Scanner? Kein Problem! Mit unserer kostengünstigen Software (HSA SCAN M) können Sie Ihre Objektträger direkt am Mikroskop manuell digitalisieren und manuelle WSI erstellen – ideal, wenn Sie später auf einen Scanner umsteigen möchten.
In diesem Video zeigen wir, wie Sie mit der HSA SCAN Software einen Objektträger manuell scannen und in eine Datei umwandeln. Diese Datei kann anschließend in der HSA KIT Software genutzt werden, um ein KI-Modell zu trainieren, das danach automatisch Erkennungen durchführt.
Möchten Sie Objektträger automatisch scannen? Rüsten Sie Ihr Mikroskop ganz einfach zu einer automatisierten Mikroskopstation (HSA SCAN A) auf. Diese Lösung verwandelt Ihr Mikroskop in kürzester Zeit in einen vollautomatischen Scanner – ideal für ein knappes Budget und gleichzeitig hohe Qualitätsanforderungen.
Alles, was HSA benötigt, sind die Abmessungen Ihres Mikroskops und die gewünschten Spezifikationen. Wir liefern Ihnen dann einen passgenauen Ständer und Motor, die optimal auf Ihr Gerät abgestimmt sind.
Ihre Vorteile:
- Deutlich schnellere Scans
- Höchste Präzision
- Zeitersparnis
- Kosteneffiziente Lösung
Im Video oben zeigen wir Ihnen den automatischen Scanner (HSA SCAN A) in Aktion. Kontaktieren Sie uns gerne für weitere Informationen oder um eine Bestellung aufzugeben.
Für weitere Informationen oder Bestellungen: sales@hs-analysis.com