Präzise Analyse mit HSA KIT

Die HSA KIT Software bietet eine benutzerfreundliche Oberfläche mit fortschrittlichen Kommentarfunktionen für pixelgenaue Präzision. Sie fördert standardisierte und konsistente Verfahren, die die Analysequalität verbessern.

Für jede Gehirnstruktur gibt es 4 Subtypen: DAPI+ Zellen (Nuclei), Olig2+ Zellen (Oligodendrozyten-Marker), CC1+ Zellen (mature Oligodendrocytes) und MBP-Signal (Myelin Basic Protein als Marker für myelinating oligodendrocytes). Diese Subtypen werden automatisch mit dem HSA-Kit analysiert und finden Anwendung in der präklinischen Forschung sowie in der diagnostischen Prädiktion von Schizophrenie.

Das obere Bild zeigt das Histogramm. In diesem sind die aus der originalen Bilddatei übernommenen Farbkanäle und deren Bezeichnung nach Häufigkeit (Y-Achse) und Helligkeit (X-Achse) der Pixel aufgeführt. Durch Linksklick auf den jeweiligen Kanal (hier DAPI, FITC, CY3 und CY5) kann dieser ein- oder ausgeschaltet werden. Durch Linksklick auf den Sub-Tab ‚SINGLE‘ wird jeweils nur ein Kanal auswählbar gemacht.

Region

Präzise Erkennung von Gehirnarealen mit HSA KIT.

Das HSA KIT ermöglicht eine genaue Erkennung der folgenden Regionen:

Pre-frontal cortex (PFC)

Cortex (Cr),

Corpus Callosum (CC),

Striatum (St),

Hippocampus (Hip),

Thalamus (Th)

Internal Capsules (IC)

Result-Tabelle

Die Tabellen geben für jeden Fluoreszenzkanal (DAPI, FITC, CY3, CY5) detaillierte Informationen über die Verteilung und Konzentration bestimmter zellulärer Marker in verschiedenen Hirnregionen wie dem präfrontalen Kortex, dem Kortex, dem Corpus Callosum, dem Striatum und dem Thalamus. Diese Marker werden verwendet, um spezifische Proteine und Zelltypen zu identifizieren, die an wichtigen physiologischen Vorgängen wie der Myelinisierung beteiligt sind oder auf krankhafte Prozesse hinweisen können.

Wichtige Spalten in den Tabellen liefern dabei entscheidende Einblicke: Die Number of Objects zeigt die Zahl der detektierten Zellen oder Strukturen, die positiv auf einen Marker reagieren, und gibt so Hinweise auf die Dichte der Zellpopulationen in den jeweiligen Hirnregionen. Die ROI area (µm²) quantifiziert die Größe der analysierten Region, was es ermöglicht, die Ausdehnung der Markerexpression zu messen. Die Mean Intensity beschreibt die durchschnittliche Fluoreszenzintensität und gibt an, wie stark ein bestimmter Marker in einer Region präsent ist. Höhere Werte deuten dabei auf eine stärkere Markerpräsenz hin.

Zudem liefern die Spalten für Max Intensity und Min Intensity die Spannweite der Fluoreszenzintensitäten, was hilft, die Variabilität der Markerexpression innerhalb einer Region zu bewerten. Die Integrated Intensity summiert die Fluoreszenz aller detektierten Objekte und gibt so einen Gesamteindruck der Markerpräsenz in einem bestimmten Bereich. Die Raw Intensity stellt die unbereinigte Gesamtintensität ohne Hintergrundkorrekturen dar und bietet eine Basis für weiterführende Analysen. Das Area of background ratio zeigt, wie viel der analysierten Fläche von Hintergrundrauschen statt von biologisch relevanten Strukturen eingenommen wird, und stellt sicher, dass die gemessene Intensität tatsächlich von den Zielobjekten stammt.

Slidescanner

Das HSA KIT kann digital generierte Mikroskopiebilder von Slide-Scannern, wie dem Axio Scan Z.1, erkennen und analysieren. Es unterstützt verschiedene Bildformate, einschließlich .tiff, .czi und .jpg. Der Axio Scan Z.1 ermöglicht das Scannen von Gewebeproben aus verschiedenen Organen, die mit unterschiedlichen Färbungen für spezifische Zellmembranen und Biomarker präpariert wurden. Dies erlaubt eine präzise und detaillierte Analyse der erfassten Bilddaten.

Workflow mit HSA KIT

Die Analyse von Proben und die Digitalisierung von Objektträgern wird mit dem HSA KIT deutlich vereinfacht. Das HSA KIT bietet eine moderne Lösung für Kunden, die ihren Workflow effizienter gestalten und mit den aktuellen technischen Standards Schritt halten möchten. Das HSA-Team unterstützt Sie während der gesamten Anwendung – von der Installation und Integration der Software bis hin zu fortlaufendem Support und regelmäßigen Aktualisierungen.

Das HSA KIT bietet einen standardisierten Prozess für die subjektive und objektive Analyse. Es ermöglicht die Extraktion relevanter Merkmale aus Rohdaten und erstellt aussagekräftige Darstellungen für das Training von KI-Modellen. Die Auswahl und Konfiguration von Modulen ist ohne umfangreiche Programmierung möglich, was den Einsatz der Software vereinfacht. Mit der benutzerfreundlichen Software lassen sich medizinische Bilder effizient annotieren, trainieren und automatisieren. Die schnelle Analyse mehrerer medizinischer Bilder kann die Zeit für Diagnose oder Behandlung erheblich verkürzen. Zusätzlich unterstützt die automatische Berichtserstellung die Produktivität und hilft Ärzten und Radiologen im Bewertungsprozess.

Wir verstehen die Bedeutung einer genauen und effizienten Analyse von Objektträgern. Aus diesem Grund bieten wir Ihnen eine Vielzahl an Funktionen, die Sie dabei unterstützen, Ihre Ziele zu erreichen.

Unsere Software ist sowohl mit Linux- als auch Windows-Betriebssystemen kompatibel und lässt sich problemlos in Docker ausführen. Dank der Offline-Funktion können Sie auch ohne Internetverbindung an Ihren digitalisierten Proben arbeiten, während Sie bei Bedarf auf die Online-Nutzung umschalten können.

Zudem ermöglichen wir eine professionelle Integration in Ihre bestehende IT-Infrastruktur, sodass die Software nahtlos in Ihre Systeme eingebunden werden kann. Sie ist so gestaltet, dass sie mit anderen Programmen zusammenarbeitet, sodass Sie alle erforderlichen Werkzeuge zur Hand haben.

Auch auf Computern mit geringerer Leistung arbeitet unsere Software zuverlässig und ermöglicht eine schnelle und präzise Analyse Proben. Mit der Möglichkeit, Berichte im CSV- oder Excel-Format zu exportieren, haben Sie alle wichtigen Daten stets leicht zugänglich.

Das integrierte Benutzerprofil-Management speichert die Historie und Einstellungen jedes Nutzers, um einen einfachen Zugriff und eine personalisierte Arbeitsumgebung zu gewährleisten.

KI-basierte Analysen können weitaus effizienter sein, sie können jedoch nur als unterstützendes Werkzeug für menschliches Fachwissen dienen und niemals eine vollständige Alternative darstellen. KI-Algorithmen neigen dazu, falsche Positive und falsche Negative zu produzieren, und können Schwierigkeiten haben, sich an Daten anzupassen, die von den Trainingsdatensätzen abweichen.

Mit unserer fortschrittlichen Technologie und einem erfahrenen Team bieten wir erstklassige Dienste zur Analyse von Objektträgern, die auf die individuellen Bedürfnisse unserer Kunden abgestimmt sind. Ob Sie eine einmalige Analyse oder eine kontinuierliche Unterstützung benötigen – wir stellen Ihnen die passenden Werkzeuge und das Fachwissen zur Verfügung, um Sie bei der Erreichung Ihrer Ziele bestmöglich zu unterstützen.

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